OSEO prendra en charge la gestion du fonds unique interministériel au moment où le 9eme appel à projets sera lancé et s’occupera désormais « des aides aux pôles de compétitivité actuellement gérées par le ministère de l’Economie, de l’Industrie et de l’Emploi ».

Cette orientation fait suite à la décision du premier Conseil de la modernisation des politiques publiques, le 12 décembre 2007, de faire de l’agence OSEO « un opérateur de référence en matière de soutien à l’innovation des entreprises ». L’agence OSEO s’est préparée à ce transfert de gestion tout au long de l’année 2008, avec la création d’une direction « Pôles de compétitivité-FUI » le 1er juillet 2008, puis la nomination de correspondants régionaux pour les pôles de compétitivité.

L’ensemble des projets de R&D sélectionnés bénéficient d’un financement de l’Etat, via le Fonds unique interministériel (FUI). Des appels à projets (AAP) publics sont lancés une à deux fois par an. Les projets de R&D sont ensuite retenus en fonction de leur caractèreinnovant et leur impact en termes d’emplois. Le FUI représente un montant de 600 M€ sur trois ans (2009-2011), fonds qui sera en majorité utilisé pour financer les projets de R&D labellisés dans le cadre des appels à projets régulièrement lancés par l’Etat depuis 2006.